“生物信息学实战:从Linux/R基础到单细胞多组学分析”培训班顺利举办
2025年7月10日至11日,由国家生物信息中心主办,浙江大学爱丁堡大学联合学院(ZJE)、中国医药教育协会医学基因组学与生物信息学专委会协办的“生物信息学实战:从Linux/R基础到单细胞多组学分析”培训班在浙江大学海宁国际校区成功举办。会议由国家生物信息中心郝丽丽副研究员主持,ZJE学院院长助理陈迪研究员致开幕词。本次培训班旨在提升学员在生物信息学领域的实战能力,特别是在单细胞多组学分析方面的技术应用。培训内容涵盖了Linux系统操作、R语言绘图、单细胞转录组数据分析以及单细胞免疫组数据分析等多个方面,旨在构建一个全面的生物信息学知识体系。7月10日的培训围绕Linux操作系统与R语言绘图基础展开。学员们系统学习了Linux系统概览、终端操作基础、文件操作与权限管理、文本处理与内容提取等核心知识;并深入掌握了R Studio开发环境配置与应用、数据整理与预处理操作、基于ggplot2的高级图形绘制与分面布局等内容。在7月11日的培训中,学员们首先聆听了迟颖教授关于人工智能驱动的动态分子结构、前沿组学和相关GPT专业纵深的报告。随后,进行了单细胞转录组数据和单细胞免疫组数据的标准分析流程培训,对序列比对、数据质控、降维聚类、鉴定差异表达基因、克隆型多样性差异分析、可视化操作等关键步骤进行了实操训练,并对于学员实操过程中需要注意的问题和需要调整的参数进行了演示。实操环节中,学员们学习了如何操作linux系统,如何使用ggplot2进行单细胞转录组数据的可视化,如何从零开始自学R包等基础知识。此外,学员们还掌握了如何按细胞类型鉴定组间差异表达基因及其相应功能通路,以及整合双组学数据鉴定存在差异克隆型的免疫细胞类型等高级技能。本次培训吸引了来自全国各地的生物信息学爱好者和专业人士。通过一天半的高强度学习和实操,学员们不仅提高了独立开展单细胞多组学研究的能力,还掌握了多组学整合分析、疾病机制挖掘等前沿技术,为未来的科研工作打下了坚实的基础。国家生物信息中心始终致力于推动生物信息学领域的蓬勃发展,本次培训不仅为学员提供宝贵的学习机会,更为国家生物信息技术体系的人才培养注入了强劲动力。此次ZJE与国家生物信息中心的首次携手合作,为学院师生在家门口搭建了一个前沿生物信息学领域的实战操作和学术交流的高端平台,是学院秉承求是创新原则,举办符合师生科研需求的学术活动的又一重要举措。展望未来,学院将持续挖掘更多与学院科研发展紧密契合的学术活动,引入前沿的学术资源。共同推动学院科研学术稳步发展。我们期待与所有致力于生物信息学研究的同仁们携手并进,共创辉煌。文:贾玲燕、郝丽丽、许田力图:周骏
2025-07-18